Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPK3BL1B0FP48 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UPK3BL1B0FP48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UPK3BL1B0FP48 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms