Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NOTOA8MTQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOTOA8MTQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms