Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MEIS3P2A8K0S8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEIS3P2A8K0S8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MEIS3P2A8K0S8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms