Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP27XA6NNY8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP27XA6NNY8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP27XA6NNY8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP27XA6NNY8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms