Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC169A6NNP5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC169A6NNP5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC169A6NNP5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms