Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRRM3A6NNA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRRM3A6NNA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms