Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EPOPA6NHQ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPOPA6NHQ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPOPA6NHQ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms