Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOL1A6NHN0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOL1A6NHN0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOL1A6NHN0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOL1A6NHN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOL1A6NHN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms