Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23AA6NH52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TVP23AA6NH52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TVP23AA6NH52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms