Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GLTPD2A6NH11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLTPD2A6NH11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLTPD2A6NH11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLTPD2A6NH11 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms