Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6L3A6NEY3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6L3A6NEY3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms