Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPN1LA6NDY0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPN1LA6NDY0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPN1LA6NDY0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPN1LA6NDY0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms