Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA6BA6NDN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA6BA6NDN3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms