Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
SSPOA2VEC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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