Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC78A2IDD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC78A2IDD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC78A2IDD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms