Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
E2F8A0AVK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F8A0AVK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F8A0AVK6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms