Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PP18

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PP18 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1W2PP18 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PP18 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A1W2PP18 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms