Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTZ2

CCDC196, Putative coiled-coil domain-containing protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC196A0A1B0GTZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC196A0A1B0GTZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC196A0A1B0GTZ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC196A0A1B0GTZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms