Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPVL1A0A0U1RR11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPVL1A0A0U1RR11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPVL1A0A0U1RR11 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms