Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1V0

IGHV3-15, Immunoglobulin heavy variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-15A0A0B4J1V0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHV3-15A0A0B4J1V0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms