Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LPK6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A096LPK6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A096LPK6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A096LPK6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A096LPK6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms