Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
A0A087WWV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
A0A087WWV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A087WWV3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
A0A087WWV3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms