Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFSF13BQ9Y275 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFSF13BQ9Y275 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms