Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB9

AURKC, Aurora kinase C, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKCQ9UQB9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AURKCQ9UQB9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AURKCQ9UQB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms