Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SHOC2Q9UQ13 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms