Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PLXNA1Q9UIW2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXNA1Q9UIW2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms