Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VPS29Q9UBQ0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms