Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ABI3Q9P2A4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ABI3Q9P2A4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms