Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VNN3Q9NY84 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms