Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SLC39A9Q9NUM3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLC39A9Q9NUM3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms