Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB6BQ9NRW1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms