Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SNX15Q9NRS6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms