Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBQLN4Q9NRR5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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