Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTPS2Q9NRF8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms