Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms