Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NRIP3Q9NQ35 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NRIP3Q9NQ35 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms