Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ELL3Q9HB65 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ELL3Q9HB65 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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