Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
REEP4Q9H6H4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms