Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms