Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AMBRA1Q9C0C7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms