Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R3Q9BXE9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R3Q9BXE9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms