Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC106Q9BWC9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms