Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SMIM2Q9BVW6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms