Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms