Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMD1Q99460 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD1Q99460 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms