Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCZQ96LD1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCZQ96LD1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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