Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNFT2Q96EX2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNFT2Q96EX2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms