Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC1Q96C34 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUNDC1Q96C34 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms