Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTSSAQ969W0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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