Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHF3Q92576 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PHF3Q92576 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PHF3Q92576 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms